MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus megaterium WSH-002 plasmid WSH-002_p3

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017141	TA	3	6	936	941	50 %	50 %	0 %	0 %	384044092
2	NC_017141	TTA	2	6	1005	1010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044092
3	NC_017141	CTT	2	6	1015	1020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044092
4	NC_017141	AAG	2	6	1209	1214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044093
5	NC_017141	AAG	2	6	1272	1277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044093
6	NC_017141	AGG	2	6	1315	1320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384044093
7	NC_017141	TTTCC	2	10	1379	1388	0 %	60 %	0 %	40 %	384044093
8	NC_017141	CTG	2	6	1416	1421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044093
9	NC_017141	T	6	6	1478	1483	0 %	100 %	0 %	0 %	384044094
10	NC_017141	AAG	2	6	1494	1499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044094
11	NC_017141	CAAAA	2	10	1619	1628	80 %	0 %	0 %	20 %	384044094
12	NC_017141	AGT	2	6	2042	2047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044095
13	NC_017141	CAG	2	6	2077	2082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044095
14	NC_017141	AGC	2	6	2090	2095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044095
15	NC_017141	CAT	2	6	2130	2135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044095
16	NC_017141	ACA	2	6	2142	2147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044095
17	NC_017141	TCAA	2	8	2187	2194	50 %	25 %	0 %	25 %	384044096
18	NC_017141	CAT	2	6	2260	2265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044096
19	NC_017141	ATC	2	6	2327	2332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044096
20	NC_017141	TC	3	6	2383	2388	0 %	50 %	0 %	50 %	384044096
21	NC_017141	TCA	2	6	2407	2412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044096
22	NC_017141	CT	3	6	2609	2614	0 %	50 %	0 %	50 %	384044097
23	NC_017141	GCTT	2	8	2615	2622	0 %	50 %	25 %	25 %	384044097
24	NC_017141	GTTA	2	8	2654	2661	25 %	50 %	25 %	0 %	384044097
25	NC_017141	ATA	2	6	2717	2722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044097
26	NC_017141	TTA	2	6	2960	2965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044098
27	NC_017141	T	6	6	2972	2977	0 %	100 %	0 %	0 %	384044098
28	NC_017141	TTC	2	6	2980	2985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044098
29	NC_017141	CAT	2	6	3009	3014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044098
30	NC_017141	CTATTC	2	12	3041	3052	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384044098
31	NC_017141	AAT	2	6	3095	3100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044098
32	NC_017141	CTG	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044098
33	NC_017141	ACA	2	6	3114	3119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044098
34	NC_017141	CTC	2	6	3121	3126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384044098
35	NC_017141	T	6	6	3151	3156	0 %	100 %	0 %	0 %	384044098
36	NC_017141	AAT	2	6	3228	3233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044098
37	NC_017141	TC	3	6	3238	3243	0 %	50 %	0 %	50 %	384044098
38	NC_017141	TC	3	6	3257	3262	0 %	50 %	0 %	50 %	384044098
39	NC_017141	AT	4	8	3263	3270	50 %	50 %	0 %	0 %	384044098
40	NC_017141	TACTG	2	10	3321	3330	20 %	40 %	20 %	20 %	384044099
41	NC_017141	CAG	2	6	3358	3363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044099
42	NC_017141	AAT	2	6	3412	3417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044099
43	NC_017141	CTG	2	6	3426	3431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044099
44	NC_017141	AACT	2	8	3482	3489	50 %	25 %	0 %	25 %	384044099
45	NC_017141	CTT	2	6	3496	3501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044099
46	NC_017141	CAA	2	6	3574	3579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044099
47	NC_017141	TTA	2	6	3582	3587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044099
48	NC_017141	TAA	2	6	3595	3600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044099
49	NC_017141	TCA	2	6	3603	3608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044099
50	NC_017141	CTC	2	6	3656	3661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384044099
51	NC_017141	TCTT	2	8	3672	3679	0 %	75 %	0 %	25 %	384044099
52	NC_017141	AAT	2	6	3697	3702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044099
53	NC_017141	GT	3	6	3721	3726	0 %	50 %	50 %	0 %	384044099
54	NC_017141	TAAT	2	8	3736	3743	50 %	50 %	0 %	0 %	384044099
55	NC_017141	ATTT	2	8	3759	3766	25 %	75 %	0 %	0 %	384044100
56	NC_017141	ATC	3	9	3793	3801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044100
57	NC_017141	AT	3	6	3806	3811	50 %	50 %	0 %	0 %	384044100
58	NC_017141	T	6	6	3823	3828	0 %	100 %	0 %	0 %	384044100
59	NC_017141	ATC	2	6	3907	3912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044100
60	NC_017141	ATAC	2	8	3948	3955	50 %	25 %	0 %	25 %	384044100
61	NC_017141	CTT	2	6	3963	3968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044100
62	NC_017141	T	7	7	4008	4014	0 %	100 %	0 %	0 %	384044100
63	NC_017141	TC	4	8	4040	4047	0 %	50 %	0 %	50 %	384044100
64	NC_017141	AATC	2	8	4179	4186	50 %	25 %	0 %	25 %	384044100
65	NC_017141	TTG	2	6	4212	4217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384044100
66	NC_017141	TA	3	6	4230	4235	50 %	50 %	0 %	0 %	384044100
67	NC_017141	AGAA	2	8	4246	4253	75 %	0 %	25 %	0 %	384044100
68	NC_017141	TCT	2	6	4266	4271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044100
69	NC_017141	TAA	2	6	4278	4283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044100
70	NC_017141	TAA	2	6	4425	4430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044100
71	NC_017141	AATCAG	2	12	4467	4478	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384044100
72	NC_017141	CTC	2	6	4495	4500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384044100
73	NC_017141	AAAG	2	8	4513	4520	75 %	0 %	25 %	0 %	384044100
74	NC_017141	CTC	2	6	4582	4587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384044100
75	NC_017141	ATC	2	6	4642	4647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044100
76	NC_017141	TC	3	6	4646	4651	0 %	50 %	0 %	50 %	384044100
77	NC_017141	ATCA	2	8	4687	4694	50 %	25 %	0 %	25 %	384044100
78	NC_017141	CTT	2	6	4709	4714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044101
79	NC_017141	T	6	6	4734	4739	0 %	100 %	0 %	0 %	384044101
80	NC_017141	A	6	6	4740	4745	100 %	0 %	0 %	0 %	384044101
81	NC_017141	TCA	2	6	4746	4751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044101
82	NC_017141	CT	3	6	4982	4987	0 %	50 %	0 %	50 %	384044102
83	NC_017141	CA	3	6	5041	5046	50 %	0 %	0 %	50 %	384044102
84	NC_017141	CTT	2	6	5060	5065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044102
85	NC_017141	AT	3	6	5213	5218	50 %	50 %	0 %	0 %	384044103
86	NC_017141	CAAA	2	8	5229	5236	75 %	0 %	0 %	25 %	384044103
87	NC_017141	A	7	7	5234	5240	100 %	0 %	0 %	0 %	384044103
88	NC_017141	TCT	2	6	5329	5334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044104
89	NC_017141	AGGCTC	2	12	5336	5347	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384044104
90	NC_017141	GTTT	2	8	5373	5380	0 %	75 %	25 %	0 %	384044104
91	NC_017141	T	7	7	5378	5384	0 %	100 %	0 %	0 %	384044104
92	NC_017141	TC	3	6	5397	5402	0 %	50 %	0 %	50 %	384044104
93	NC_017141	TTAT	2	8	5475	5482	25 %	75 %	0 %	0 %	384044104
94	NC_017141	TGT	2	6	5553	5558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384044104
95	NC_017141	TCA	2	6	5601	5606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044104
96	NC_017141	CTT	2	6	5656	5661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044104
97	NC_017141	CAT	3	9	5674	5682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044104
98	NC_017141	TAT	2	6	5693	5698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044104
99	NC_017141	GAT	2	6	5761	5766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044104
100	NC_017141	CTTA	2	8	5774	5781	25 %	50 %	0 %	25 %	384044104
101	NC_017141	TCT	2	6	5786	5791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044104
102	NC_017141	TGA	2	6	5799	5804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044104
103	NC_017141	ACC	2	6	5869	5874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384044104
104	NC_017141	CAC	2	6	5879	5884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384044104
105	NC_017141	T	7	7	6239	6245	0 %	100 %	0 %	0 %	384044105
106	NC_017141	TTTC	2	8	6336	6343	0 %	75 %	0 %	25 %	384044105
107	NC_017141	TC	3	6	6351	6356	0 %	50 %	0 %	50 %	384044105
108	NC_017141	TA	3	6	6387	6392	50 %	50 %	0 %	0 %	384044105
109	NC_017141	ACC	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384044105
110	NC_017141	CTC	2	6	6536	6541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384044105
111	NC_017141	T	6	6	6588	6593	0 %	100 %	0 %	0 %	384044105
112	NC_017141	CTT	2	6	6644	6649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044105
113	NC_017141	ACTT	2	8	6689	6696	25 %	50 %	0 %	25 %	384044105
114	NC_017141	TGCTC	2	10	6762	6771	0 %	40 %	20 %	40 %	384044105
115	NC_017141	CAT	2	6	6797	6802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044105

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.